Σε μια εποχή που χιλιάδες Ιρλανδοί μετακινούνταν είτε προς την Αμερική είτε προς την Αγγλία, κρατώντας την ελπίδα τους για μια νέα ζωή, ο Shane, παρασυρμένος από την παιδική του ηλικία στην Ιρλανδία, αγκάλιασε τον ιρλανδικό πολιτισμό και Iστορία σε μια εποχή μαζικής ανεργίας και τρομοκρατίας στο σπίτι. Όμως, όπως πολλοί από τους λογοτεχνικούς του ήρωες, ο MacGowan επρόκειτο να βυθιστεί περαιτέρω στη χρήση ναρκωτικών και την υπέρμετρη κατανάλωση αλκοόλ. Μισούσε τη φήμη και την αντιμετώπισε μέσω της ολοκληρωτικής παράδοσης στους εθισμούς του. Αποκομμένος από το συγκρότημα, ξεκίνησε να διαλύει τον θρύλο που είχε δημιουργηθεί γύρω του, έναν θρύλο με τον οποίο δεν ένιωθε ποτέ άνετα, σχηματίζοντας τους The Popes, που έβγαζαν μια κακώς εννοούμενη αίσθηση cartoon και με τους οποίους ήταν ενεργός για μεγάλες περιόδους της δεκαετίας του΄90.
Μια βραχύβια επανένωση με τους The Pogues το 2001 σίγουρα προσέλκυσε πλήθη, αλλά μέχρι τότε είχε γίνει απρόβλεπτος, οξύθυμος ή απλώς απών. Οι συναυλίες έγιναν όλο και πιο δύσκολες και οι δημόσιες εμφανίσεις ήταν λιγότερο συχνές. Μετά από ένα ατύχημα το 2016, ήταν σε μεγάλο βαθμό καθηλωμένος σε αναπηρικό αμαξίδιο. Ο Shane παντρεύτηκε την επί χρόνια σύντροφό του Victoria Mary Clarke το 2018 και ζούσαν στο Δουβλίνο, αλλά τους τελευταίους μήνες έμπαινε και έβγαινε από το νοσοκομείο.
Με την πραγματική αγάπη που έτρεφε για τα παραδοσιακά ιρλανδικά τραγούδια, την επαναστατική ενέργεια του πανκ που έβγαζε στην ερμηνεία του, ο MacGowan άνοιξε την πόρτα στην ιρλανδική μουσική σε εκατομμύρια που ίσως να μην την είχαν βιώσει ποτέ, μοίρασε περηφάνια στους συμπατριώτες του στη Βρετανία και έκανε την ίδια την Ιρλανδία cool.